A estação é formada por cerca de 2 mil hectares no interior da Área de Proteção de Guapimirim.
No Dia Mundial de Proteção aos Manguezais, a Estação Ecológica da Guanabara comemora dez anos de existência. Segundo a analista ambiental do Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade Juliana Cristina Fukoda, essa é a área mais preservada de toda Baía de Guanabara.
Para o chefe da Área de Preservação Ambiental de Guapimirim Maurício Muniz, a Estação Ecológica é um exemplo vivo de que toda a Baía de Guanabara pode ser recuperada e preservada.
Criada em 2006, a Estação Ecológica da Guanabara abrange parte dos municípios de Itaboraí e Guapimirim, na região metropolitana do Rio de Janeiro. A estação é formada por cerca de 2 mil hectares no interior da Área de Proteção de Guapimirim.